Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6BP04259 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms