Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VIPP01282 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VIPP01282 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VIPP01282 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms