Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms