Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR1AO95602 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1AO95602 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms