Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG7O95352 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms