Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRATO95237 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRATO95237 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRATO95237 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms