Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RDH16O75452 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH16O75452 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms