Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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