Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms