Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF1O43189 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF1O43189 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF1O43189 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF1O43189 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PHF1O43189 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PHF1O43189 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PHF1O43189 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PHF1O43189 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PHF1O43189 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF1O43189 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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