Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC3O15379 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms