Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP290O15078 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CEP290O15078 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP290O15078 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP290O15078 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEP290O15078 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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