Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms