Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLDN25C9JDP6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLDN25C9JDP6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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CLDN25C9JDP6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN25C9JDP6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLDN25C9JDP6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN25C9JDP6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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