Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms