Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms