Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms