Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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