Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMX2A2RU54 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms