Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
V9GYV3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
V9GYV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
V9GYV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
V9GYV3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
V9GYV3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
V9GYV3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
V9GYV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
V9GYV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
V9GYV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
V9GYV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms