Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERP1Q9Y6X1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERP1Q9Y6X1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SERP1Q9Y6X1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SERP1Q9Y6X1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SERP1Q9Y6X1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms