Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPTNQ9Y639 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPTNQ9Y639 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPTNQ9Y639 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms