Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC1Q9Y5R8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAPPC1Q9Y5R8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms