Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms