Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP15Q9Y4E8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP15Q9Y4E8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP15Q9Y4E8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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