Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHTOPQ9Y3Y2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms