Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIT1Q9Y2X7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GIT1Q9Y2X7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GIT1Q9Y2X7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms