Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KDM2AQ9Y2K7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM2AQ9Y2K7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM2AQ9Y2K7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms