Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM33Q9UPN9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM33Q9UPN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms