Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF19Q9UMS4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF19Q9UMS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms