Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA11Q9UKX5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA11Q9UKX5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA11Q9UKX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms