Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH13Q9UKX3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH13Q9UKX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH13Q9UKX3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms