Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO4Q9UKT5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO4Q9UKT5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO4Q9UKT5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms