Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP8AP2Q9UKL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CASP8AP2Q9UKL3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms