Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf18Q9UK00 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf18Q9UK00 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf18Q9UK00 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf18Q9UK00 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms