Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFMBT1Q9UHJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFMBT1Q9UHJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms