Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHORDC1Q9UHD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHORDC1Q9UHD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms