Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPASTQ9UBP0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPASTQ9UBP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms