Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CC2D2AQ9P2K1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC43■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.47
CC2D2AQ9P2K1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CC2D2AQ9P2K1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CC2D2AQ9P2K1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms