Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC88CQ9P219 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC88CQ9P219 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms