Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAPAQ9P0L0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAPAQ9P0L0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms