Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCKIPSDQ9NZQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKIPSDQ9NZQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.3 ms