Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRN3Q9NYV6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRN3Q9NYV6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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