Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM9Q9NXL9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MCM9Q9NXL9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MCM9Q9NXL9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MCM9Q9NXL9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms