Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM260Q9NX78 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms