Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAJC28Q9NX36 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms