Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCMTD2Q9NV79 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms