Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM39AQ9NV64 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM39AQ9NV64 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms