Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACER3Q9NUN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACER3Q9NUN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACER3Q9NUN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACER3Q9NUN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACER3Q9NUN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACER3Q9NUN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACER3Q9NUN7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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