Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A13Q9NSD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC6A13Q9NSD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms